Een afgelegen fabriek in Europa houdt zijn gevaarlijke anacondaproject geheim. Maar ze zijn niet langer in staat de monsters die ze hebben gecreëerd onder controle te houden en 2 Annacondas weten te ontsnappen. Om een internationale crisis te voorkomen wordt de meedogenloze Hammett ingehuurd om de beesten op te sporen en te vernietigen. Maar de tijd begint te dringen want een van de Anacondas is zwanger en staat op het punt een heel nest bloeddorstige nakomelingen te werpen.